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分子互作資料

LSPR技術(shù)

技術(shù)指南:COOH傳感器與胺偶聯(lián)試劑盒


1、概述
    在COOH傳感器芯片表面上具有均勻的的羧基層。這些羧基能夠被標(biāo)準(zhǔn)EDC/NHS化學(xué)物激活并通過氨基化學(xué)偶聯(lián)配體 (圖1)。Nicoya胺基偶聯(lián)試劑盒中包含所有完成該偶聯(lián)所需的試劑而且試劑盒已被優(yōu)化為最佳性能。這種耦聯(lián)方法使得配體穩(wěn)定的附著于表面,并且結(jié)合的相互作用可以很容易在OpenSPR儀器上測量。

LSPR技術(shù)1

共價(jià)偶聯(lián)

2、實(shí)驗(yàn)需要的試劑及儀器
● COOH傳感器芯片:儲(chǔ)存在2-8°C
● NHS:儲(chǔ)存在2-8°C,一旦稀釋分裝,儲(chǔ)存在–20°C
● EDC:儲(chǔ)存在2-8°C,一旦稀釋分裝,儲(chǔ)存在–20°C
● 激活緩沖液:儲(chǔ)存在2-8°C
● 封閉液:儲(chǔ)存在2-8°C
● 運(yùn)行緩沖液:1X PBS pH 7.4(需要老師配)
● 80%的IPA (異丙醇)(需要老師提供)
● 去離子水(需要老師提供)
● 瞬時(shí)離心機(jī)(需要老師提供)
● 移液槍及槍頭(1ml,200ul,100ul)(需要老師提供)
● 配體(固定到芯片):蛋白純度高于90%,濃度(30-100ug/ml),體積大于200ul
● 分析物:蛋白或大分子濃度(30-100ug/ml),體積大于200ul,小分子(溶于DMSO的)要求濃度大于100uM 或30mg/ml
● 再生緩沖液100mM的HCL,或1%的SDS
 
EDC分裝準(zhǔn)備

1)將EDC溶解于1mL活化緩沖液中
2)用移液器分裝成10個(gè)100μL,儲(chǔ)存在–20°C.
NHS 分裝準(zhǔn)備
1)將NHS溶解于1mL活化緩沖液中
2)用移液器分裝成10個(gè)100μL,儲(chǔ)存在–20°C.
注:試劑必須從分裝瓶里現(xiàn)取現(xiàn)用,且在使用前混合。EDC / NHS酯的半衰期較短,因此配體激活后立刻上樣。此外,蛋白質(zhì)長時(shí)間在低pH值下通常不穩(wěn)定,所以配體稀釋到激活緩沖液后要立即注入。
 
 LSPR技術(shù)2
再生緩沖液參考:

     1. Acid 5-150 mM

2. SDS 0.01 – 0.5%

 Proteins

Peptides

Antibodies

Proteins/Nucleic acids

3. NaoH 10 mM

4. IPA:HCl 1:1

Nucleic acids/Nucleic acids

■Lipids

 

緩沖條件
   通常將大的配體如蛋白質(zhì)固定在COOH傳感器芯片上的方法預(yù)富集。預(yù)富集是利用靜電力在傳感器的表面增加配體的局部濃度的技術(shù)。Nicoya為預(yù)富集提供了優(yōu)化的激活緩沖液與胺偶聯(lián)試劑盒。不能被預(yù)富集的配體,需要通過其他方法固定,如通過組氨酸標(biāo)簽捕獲偶聯(lián)。
注意,緩沖液中胺組或強(qiáng)親核試劑如Tris或疊氮化鈉應(yīng)避免與胺基耦聯(lián),因?yàn)檫@些基團(tuán)將與配體競爭。
如果胺基耦聯(lián)試劑盒不能達(dá)到足夠的固定水平,可嘗試增加的配體的濃度。如果它仍然不夠,則需要進(jìn)一步優(yōu)化激活緩沖液。

 

3、COOH傳感器芯片實(shí)驗(yàn)步驟:

注–本程序假設(shè)儀器中使用的是100μL的樣品環(huán)。如果要安裝更大的樣品環(huán),則需要重新調(diào)整體積。

1)按照標(biāo)準(zhǔn)程序,在OpenSPR儀器上安裝羧基傳感器芯片。
2)開始以最大流速運(yùn)行緩沖液(ex.1X PBS pH 7.4)。
3)在達(dá)到信號(hào)基線后,從上樣口注入80%的IPA,將控制閥轉(zhuǎn)到inject,運(yùn)行10s轉(zhuǎn)回到load進(jìn)行排氣泡,達(dá)到基線后,緩沖液沖洗樣本環(huán),并用空氣排空。
4)注入10mM的Hcl 清洗芯片表面,運(yùn)行1min(芯片第一次用時(shí)需要此步驟)
5)減慢緩沖液流速至20μl/min。
6)解凍并立即混合1等分的EDC和NHS,注入到儀器中。與傳感器相互作用5分鐘。一旦相互作用結(jié)束,用緩沖液沖洗上樣口并用空氣排空。
7)用激活緩沖液稀釋用于固定的配體, 體積為200μL濃度為10-50μg/mL。稀釋后立即將配體注入儀器(相互作用5分鐘 )。在EDC / NHS完成抽吸后,這步需要快速連續(xù)的進(jìn)行。用緩沖液沖洗上樣口并用空氣排空。
單位換算:10ug/ml=10mg/L=[10mg/MW/mol)]/L=?mM/L = ?uM/L)
8)注入250μL封閉液(互相作用5分鐘 )。一旦封閉液已經(jīng)通過,傳感器就可準(zhǔn)備用于測量分析物和配體之間的結(jié)合相互作用。沖洗和清除樣品回路。
9)通過比較EDC/NHS活化前與閉鎖后的信號(hào),測量配體結(jié)合量。在圖2所示的示例中,它是約700pm。
10)如有已知的再生緩沖液條件,將泵的速度提高到150ul/min,注入再生緩沖液初始化配體表面。
11)將泵速調(diào)到20ul/min,注入高濃度的分析物以確認(rèn)配體的活性,并確認(rèn)表面的近似的最大結(jié)合能力。清洗及排空樣本環(huán)。
12)提高泵速到150μL/min,準(zhǔn)備適當(dāng)?shù)脑偕彌_液和裝載250μL并注入以去除分析物。芯片表面即可用于分析物動(dòng)力學(xué)分析。
如下圖所示的例子。

LSPR技術(shù)2
圖2     COOH傳感器芯片配體的制備
                                          

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